Manažérstvo predstavuje súbor dobrovoľných nástrojov environmentálnej politiky umožňujúcich zavedenie systémového prístupu do riešenia problémov ochrany starostlivosti o prostredie zvyšovania správania organizácií aplikovaním ekoinovačných trendov. Hlavné aktivity Slovenskej agentúry životného prostredia úseku environmentálneho manažérstva sa sústreďujú na nasledujúce oblasti a činnosti: