V roku 2004 začala SAŽP s budovaním integrovaného systému manažérstva, ktorý zahŕňa systém manažérstva kvality podľa normy STN EN ISO 9001 a systém environmentálneho manažérstva podľa normy STN EN ISO 14001. Systém bol úspešne certifikovaný v roku 2005 a v roku 2011 bol vykonaný druhý recertifikačný audit.
Integrovaný systém manažérstva pokrýva všetky procesy a činnosti, ktoré majú vplyv na kvalitu poskytovaných služieb a na environmentálne vplyvy prevádzkových činností SAŽP na životné prostredie.
Pre úspešné fungovanie systému boli stanovené, sú trvale udržiavané a zlepšované zásady procesného riadenia podľa požiadaviek obidvoch noriem a potrieb SAŽP.
SAŽP identifikovala environmentálne aspekty svojich procesov, činností a zariadení a prostredníctvom stanovených cieľov a programov na ich realizovanie riadi významné environmentálne aspekty s cieľom zlepšovania svojho environmentálneho správania.
