Národná stratégia ochrany biodiverzity na Slovensku bola spracovaná v období rokov 1996 až 1997 ako odpoveď na článok 6 Dohovoru o biologickej diverzite, ktorý vyžaduje, aby “každá zo zmluvný strán v súlade so svojimi špecifickými podmienkami a možnosťami rozvíjala národné stratégie, plány alebo programy na ochranu a trvalo udržateľné využívanie biologickej diverzity”.

    Urýchlená príprava Stratégie bola tiež podporená Deklaráciou ministrov životného prostredia regiónu Európskej hospodárskej komisie OSN schválenej na tretej konferencii “Životné prostredie pre Európu” v Sofii v roku 1995, ktorá v odstavci 28 požadovala, aby do roku 1998 každá zmluvná strana vypracovala národné stratégie, plány a programy o biologickej diverzite.

    Národná stratégia ochrany biodiverzity bola schválená vládou SR 1. apríla 1997 uznesením č. 231. Národná rada SR ju odsúhlasila 2. júna 1997. Vychádzajúc z Dohovoru o biologickej diverzite pri implementácii Národnej stratégie ochrany biodiverzity na Slovensku sa musia brať do úvahy tieto riadiace princípy:

• biodiverzita sa musí chrániť v celej šírke - prednostne in-situ (v mieste výskytu),
• umelo vyvolaný úbytok biodiverzity sa musí kompenzovať v najvyššej možnej miere,
• diverzita krajiny sa musí zachovať, aby sa zachovala variabilita foriem života na všetkých úrovniach,
• prírodné zdroje sa musia vždy využívať trvalo udržateľným spôsobom,
• každý musí byť zodpovedný za ochranu biodiverzity a jej trvalo udržateľné využívanie.